Ingénieur en modélisation computationnelle, intelligence artificielle (IA) et développement de pipelines pour la recherche sur les nanoparticules lipidiques (LNP) et l’administration d’ARN – H/F Stage

L’établissementL’École normale supérieure de Lyon produit une recherche de haut niveau dans ses 25 laboratoires et forme par la recherche quelque 2500 étudiants dont 500 doctorants. Elle compte environ 550 enseignants, enseignants-chercheurs et chercheurs et 600 personnels administratifs et techniques. Dans le classement de Shanghai et QS, elle se classe au 1er rang des établissements français en termes de performance per capita. Son objectif est d’avoir un impact significatif en matière de recherche, d’innovation et de transfert de technologie tout en irriguant la fonction publique et le monde socio-économique de diplômés rompus à la complexité, capables de produire et transmettre des savoirs. L’ENS de Lyon met ses ressources au service d’une vision ouverte de la société et des enjeux contemporains qu’elle veut éclairer.L’Ecole normale supérieure de Lyon est implantée sur 112 829 m2 répartis sur 2 sites très proches l’un de l’autre : René Descartes (siège) et Jacques Monod.Elle dispose ;

• d’une bibliothèque Diderot de Lyon (1,2 million de volumes disponibles sur le site René Descartes) proposant des collections en SHS (site Descartes), en sciences exactes et expérimentales (site Monod) et en éducation (site Descartes).
• d’un théâtre : la salle Kantor ;
• d’un studio de cinéma : la salle Jean-Claude Carrière ;
• de deux salles de musique ;
• de deux gymnases
• de deux restaurants : un sur le site Descartes et un sur le site Monod.

Son budget annuel est d’environ 150 M €.L’ENS de Lyon est une école dynamique, où la qualité de vie et des conditions de travail, le développement durable et l’égalité professionnelle représentent des dimensions centrales.Le posteCONTEXTE :L’équipe DAMM est l’une des 15 équipes affiliées au Laboratoire de Biologie et Modélisation de la Cellule (LBMC) situé à l’Ecole Normale Supérieure de Lyon. Le projet de recherche vise à améliorer les systèmes d’administration d’ARN messager (mRNA) à l’aide de simulations de dynamique moléculaire à gros grains (CG-MD), d’apprentissage machine (ML) et de modélisation intégrative. Les travaux sont réalisés dans un environnement interdisciplinaire, en collaboration avec des experts en chimie computationnelle, biophysique et intelligence artificielle, à l’interface entre monde académique et industriel.MISSIONS & ACTIVITÉS DU POSTE :Notre groupe recherche un ingénieur d’étude pour contribuer à un projet de recherche de pointe portant sur la modélisation computationnelle, les nanoparticules lipidiques (LNP) et le développement de solutions d’administration de médicaments assistées par l’IA. L’ingénieur travaillera en autonomie technique et sera en charge de :– Mise en place de pipelines automatisés pour les simulations de dynamique moléculaire (MD) et l’intégration de données expérimentales.– Étude et analyse de la structure et de la dynamique des interactions entre LNPs et ARN par simulations de dynamique moléculaire (CG-MD) et méthodes d’apprentissage automatique (ML).
– Transfert des résultats obtenus sous forme de rapports structurés, de scripts reproductibles et d’analyses à destination des collaborateurs académiques et industriels.– Déterminer les paramètres optimaux pour la prédiction de l’efficacité d’administration de l’ARN en utilisant des approches intégratives combinant MD et ML.Profil recherchéCOMPETENCES ATTENDUES :Connaissances :-Simulation de dynamique moléculaire (MD) et modélisation computationnelle.-Bases de l’apprentissage automatique appliqué à la modélisation moléculaire.-Biophysique des nanoparticules lipidiques (un atout).-Bioinformatique appliquée aux systèmes biomoléculaires.Savoir faire :-Développement de pipelines d’automatisation pour les simulations.-Programmation (Python, Bash) et expérience avec GROMACS ou équivalent-Traitement et analyse de grandes séries de données issues de simulations.-Utilisation de logiciels d’analyse de trajectoires moléculaires.-Analyse de données, modélisation prédictive et transmission des résultats.-(Autres) Utilisation de ressources de calcul intensif (HPC).Savoir être :-Autonomie-Capacité d’organisation-Capacité à communiquer-Être coopératifDurée du contrat en mois : 12 moisDate d’embauche : Dès que possible, au plus tard le 01/09/2025Diplôme souhaité : Master 2 en modélisation moléculaire, bioinformatique, chimie, biophysique computationnelle ou domaines proches.Expérience souhaitée : Expérience en stage ou en projet de recherche utilisant des simulations de dynamique moléculaire ou de la modélisation biomoléculaire.Rémunération indicative (visible par les candidats) : Selon la grille de l’ENS.

École normale supérieure de Lyon